Академия является высшим военным учебным заведением, осуществляющим профессиональную подготовку кадров органов Министерства Национальной Безопасности, подготовку высококвалифицированных специалистов, а также офицеров пограничников и пограничных контролеров для Государственной Пограничной Службы. В Академии проводится учебно-методическая и научно-исследовательская работа по всем специальностям. В будущем для повышения научного потенциала, организации и направления научно-исследовательских работ предусматривается создание аспирантуры и докторантуры. В Академии налажено основанное на деловых связях полезное сотрудничество с соответствующими министерствами и государственными комитетами, высшими учебными заведениями республики, а также с некоторыми зарубежными странами и международными организациями. В Академии действуют специальная и общая библиотека, имеющие богатый книжный фонд. Для обеспечения высокого уровня учебного процесса созданы специальные аудитории, кабинеты, компьютерные залы, оснащенные современными компьютерами, аудио-видео техникой, стендами. В Академии имеются также спортивные залы и площадки с необходимыми оборудованиями и тренажерами. Зачисленные в Академию курсанты принимаются на государственное обеспечение - выдается военная форма, обеспечиваются ежедневным питанием и общежитием, в котором созданы бытовые условия высокого уровня. Все курсанты, обучающиеся в Академии, получают стипендию. С целью поощрения курсантов-отличников, достигших высоких успехов в учебе, занимающихся научно-творческой работой и активно участвующих в общественной жизни Академии учреждена стипендия имени Гейдара Алиева. В период учебы курсанты проходят практику в органах Министерства Национальной Безопасности и пограничных отрядах Государственной Пограничной Службы. Курсантам, окончившим Академию, выдается диплом и присваивается офицерское звание "лейтенант", и, в зависимости от специальности они получают направление на работу в органы национальной безопасности или Государственную Пограничную Службу Республики. Факультеты: Факультет подготовки оперативных работников; Факультет пограничных войск; Факультет переподготовки и усовершенствования кадров. На факультетах функционируют 14 кафедр, в том числе 3 кафедры особого назначения - тактика пограничных войск, инженерно-технические дисциплины, общевойсковые предметы, уголовное право, уголовный процесс и криминалистика, конституционное право, гражданское право, информационные технологии и информационная безопасность, административное управление, иностранные языки, общественно-политические предметы, физическая подготовка.