В 1937 г. на основе приказа Азербайджанского Центрального Комитета от 1925 г. «Об изучении природных ресурсов республики и районировании» в составе Азербайджанского филиала АН СССР был создан сектор географии, тем самым были заложены основы азербайджанской школы географии, всегда занимавшей особое место в научной среде бывшего СССР.С образованием данного сектора наука география завершила свою описательную функцию и в Азербайджане начинаются системные географические исследования.Под руководством таких великих ученых как И.В. Фигуровский, Г.А. Алиев, Р.В. Ковалев и Г.Б. Алиев в течение восьмилетней деятельности сектора проводились исследования по физической и экономической географии, географии почв, картографии, сейсмологии и астрономии.
1 мая 1945 г. на базе данного сектора организуется Институт географии АН Азербайджанской ССР, директором которого назначается Г.Б. Алиев.За 60-летнюю деятельность института помимо Г.Б. Алиева (1945-1948) им руководили А.М. Шихлинский (1948-1951), А.А. Мадатзаде (1951-1957), Г.К. Гюль (1957-1964), С.Г. Рустамов (1964-1967), Г.А. Алиев (1967-1988) и Б.А. Будагов (1988-2012).С июля 1945 г. в институте начинают действовать отделы физической и экономической географии, картографии. Одной из основных тем исследований становится география горных стран. Несмотря на то, что в первые годы не было ни одного сотрудника с ученой степенью, уже в 1947 г. из работающих в институте 20 человек 11 были кандидаты наук, а 3 человека поступили в аспирантуру.Принимая во внимание обширность объектов и тем географических исследований, кадрового потенциала в 1950 г. структуру института составляло уже 6 отделов.С 1959 г. при Институте географии действует «Центр проблем Каспийского моря».