Ağdaş Rayon Məhkəməsi birinci instansiya məhkəməsi kimi Ağdaş rayonunun ərazisi çərçivəsində qanunla səlahiyyətlərinə aid edilmiş mülki, cinayət, inzibati xətalara dair və digər işlərə baxır.Ağdaş Rayon Məhkəməsi 1930-cu ildə yaranmış, əvvəlki adı Ağdaş Rayon Xalq Məhkəməsi olmuşdur.