Создание Академии Юстиции, являющимся одним из важных институтов государственности и играющего важную роль в формировании и развитии органов юстиции независимой Азербайджанской Республики, а также осуществляющего подготовку нового поколения профессиональных и квалифицированных кадров, непосредственно связано с именем Президента Азербайджанской Республики.В различные периоды в Азербайджанской Республике переподготовкой юридических кадров занимались различные структуры Министерства Юстиции и Верховного Суда.22 июня 1993 года принята решение о создании Института усовершенствования юридических кадров имени Халилбека Хасмамедова при Министерстве Юстиции Азербайджанской Республики.
С целью формирования новой судебной системы в Азербайджанской Республике, роста профессиональной подготовки судей и кандидатов в судьи, юридических кадров, работающих в органах юстиции, а также в целях обеспечения проведения научных исследований, касающихся юридических областей, Распоряжением Президента Азербайджанской Республики от 14 мая 1999-го года на основе Института повышения квалификации юридических кадров, действующего при Министерстве Юстиции был создан Учебно-правовой центр при Министерстве Юстиции.В соответствии с Указом Президента Азербайджанской Республики от 17 августа 2006-го года "О развитии органов юстиции" в структуре Министерства Юстиции была создана Академия Юстиции. Указом от 21 ноября 2008-го года утвержден Устав Академии Юстиции.